Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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ATRQ13535 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ATRQ13535 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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ATRQ13535 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATRQ13535 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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