Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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MKRN4PQ13434 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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MKRN4PQ13434 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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MKRN4PQ13434 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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MKRN4PQ13434 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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MKRN4PQ13434 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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MKRN4PQ13434 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MKRN4PQ13434 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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MKRN4PQ13434 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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MKRN4PQ13434 GEMIN2-202ENST00000308317 1420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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MKRN4PQ13434 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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MKRN4PQ13434 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
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MKRN4PQ13434 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MKRN4PQ13434 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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