Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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PTP4A2Q12974 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTP4A2Q12974 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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