Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRJQ12913 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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