Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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CDH17Q12864 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CDH17Q12864 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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CDH17Q12864 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDH17Q12864 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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