Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NFIAQ12857 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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