Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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RAB40BQ12829 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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RAB40BQ12829 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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RAB40BQ12829 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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RAB40BQ12829 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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RAB40BQ12829 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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RAB40BQ12829 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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RAB40BQ12829 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RAB40BQ12829 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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