Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TROQ12816 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TROQ12816 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TROQ12816 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TROQ12816 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TROQ12816 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TROQ12816 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TROQ12816 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TROQ12816 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TROQ12816 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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