Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FAM27E3Q08E93 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM27E3Q08E93 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms