Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SSRP1Q08945 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSRP1Q08945 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms