Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SRSF4Q08170 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms