Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CREMQ03060 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREMQ03060 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREMQ03060 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREMQ03060 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREMQ03060 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CREMQ03060 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CREMQ03060 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms