Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NUCB1Q02818 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NUCB1Q02818 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms