Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDKL1Q00532 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms