Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTRA4P83105 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms