Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PITX1P78337 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PITX1P78337 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms