Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ACTA1P68133 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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