Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP1S1P61966 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms