Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UFM1P61960 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UFM1P61960 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms