Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK-21P61565 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms