Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BRCA2P51587 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms