Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NESP48681 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NESP48681 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NESP48681 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NESP48681 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms