Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRB2P47870 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABRB2P47870 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms