Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RECQLP46063 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RECQLP46063 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RECQLP46063 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RECQLP46063 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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