Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RANGAP1P46060 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RANGAP1P46060 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms