Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GPD2P43304 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GPD2P43304 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GPD2P43304 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPD2P43304 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms