Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PPARGP37231 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGP37231 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGP37231 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms