Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms