Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXA10P31260 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms