Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRKCHP24723 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms