Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP4AP20648 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms