Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRHP20396 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRHP20396 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRHP20396 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRHP20396 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRHP20396 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRHP20396 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRHP20396 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRHP20396 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms