Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 SRRM4-201ENST00000267260 8477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RAB4AP20338 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms