Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ITGB6P18564 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms