Protein–RNA interactions for Protein: P17706

PTPN2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN2P17706 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN2P17706 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.7 ms