Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CKMT2P17540 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms