Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
EPCAMP16422 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPCAMP16422 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms