Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRAFP15056 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
BRAFP15056 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
BRAFP15056 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BRAFP15056 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BRAFP15056 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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