Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT3P12035 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KRT3P12035 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KRT3P12035 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms