Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DMDP11532 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DMDP11532 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DMDP11532 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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