Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ESRRAP11474 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms