Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms