Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HKR1P10072 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HKR1P10072 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HKR1P10072 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HKR1P10072 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HKR1P10072 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HKR1P10072 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HKR1P10072 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HKR1P10072 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HKR1P10072 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HKR1P10072 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HKR1P10072 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HKR1P10072 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HKR1P10072 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HKR1P10072 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HKR1P10072 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HKR1P10072 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HKR1P10072 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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