Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C4BP0C0L5 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms