Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHOP08100 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHOP08100 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOP08100 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOP08100 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOP08100 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOP08100 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOP08100 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOP08100 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOP08100 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOP08100 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOP08100 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOP08100 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOP08100 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOP08100 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOP08100 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOP08100 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RHOP08100 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RHOP08100 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms