Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APODP05090 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APODP05090 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APODP05090 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APODP05090 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APODP05090 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
APODP05090 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APODP05090 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
APODP05090 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APODP05090 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APODP05090 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms