Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACSL4O60488 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACSL4O60488 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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