Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KIF1CO43896 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms