Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
HOXA3O43365 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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HOXA3O43365 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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HOXA3O43365 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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HOXA3O43365 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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HOXA3O43365 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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HOXA3O43365 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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HOXA3O43365 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HOXA3O43365 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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