Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LRRTM2O43300 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LRRTM2O43300 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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